Számlaközpont választása esetén az e-számlák az Számlaközpont Zrt. rendszerein kerülnek hitelesítésre, tárolásra és kézbesítésre (ehhez külön szerződés szükséges a felhasználó és az e-számla szolgáltató között), valamint a Hiteles számla archiválás beállítása esetén a hitelesített számlák automatikusan visszatöltésre kerülnek a sERPa-ba.
Számlaközpont szolgáltató választása esetén a Használható vevőszámlához és a Használható szállítószámlához jelölőnégyzetek nem jelennek meg a felületen, mivel a Számlaközpont csak vevőszámlán érhető el, kötelezően.